广安门医院肿瘤科成立于1963年，1974年设立肿瘤病房。由于科室注重人才培养、硬件设施建设，注重中医、中西医结合的研究和组织管理，肿瘤科从此不断发展壮大，成为在国际和国内知名的肿瘤医疗单位。1977年肿瘤科配备了全国第一个中医、中西医结合肿瘤临床研究室。1993年肿瘤科被批准成为“全国中医肿瘤专科医疗建设中心”，1994年被国家教委批准成立博士研究生带教单位，1995年被国家中医药管理局批准为肿瘤重点研究室，并成立博士后流动站。1997年2月正式通过国家验收成为“全国中医肿瘤专科医疗中心”，2001年通过国家中医药管理局三级实验室验收，并批准成为全国中医肿瘤学科建设单位。
目前我科融医疗、科研、教学为一体，下设医疗科研两大系统。在医疗方面设有门诊和病房，门诊开设特需专家门诊、普通专家门诊、专题门诊、咨询门诊、普通门诊，疑难病会诊门诊、肿瘤预防门诊，平均日门诊量在280人左右，患者来自祖国的四面八方，还有部分国外患者前来求医，同时还承担国家领导干部的医疗保健工作。除了医院现有的诊断检查外，我科还配备了专门人员开展胃镜、气管镜检查和呼吸功能测定等工作。病房现有床位120张，下设普通病房、高干病房、特需病房。求诊患者均采用中医、中西医结合的综合治疗，治疗手段包括中医中药、化疗、放疗、导管介入治疗、生物治疗及针灸、外敷熏洗治疗等，医生根据患者病情和病种的不同选用适当的治疗手段。开展的特色治疗主要包括：中医药配合放、化疗增强疗效、减轻毒副作用的治疗；手术、放化疗后采用中医药预防肿瘤术后复发转移、延长生存期的治疗；晚期肿瘤患者改善临床症状、提高生存质量、延长生存期的治疗。
    多年的临床实践表明，我们的特色中医治疗可以明显提高肿瘤患者的临床疗效，减轻患者痛苦和延长患者的生存时间，治疗理念和治疗疗效在全国处于领先地位。此外，我科还设有肺癌、胃肠道癌、肝癌、乳腺癌等临床专题协作治疗组，对各种癌症的综合治疗进行了深入研究，现已研制出针对肺癌、胃肠道癌、肝癌、恶性淋巴瘤及恶性胸、腹水治疗特色的院内制剂如西黄解毒胶囊、肺瘤平膏、扶正解毒口服液、肝康冲剂、健脾益肾冲剂、软坚消瘤片、妇科消瘤丸等十余种院内制剂。这些制剂疗效确切，无明显毒副作用，不仅广泛用于祖国各地的求诊患者，还深受马来西亚、新加坡、韩国等东南亚国家患者的推崇，取得了良好的社会效益和经济效益。
    作为国家中医肿瘤专科医疗中心，科研也是我们工作的重要组成部分。70年代，我肿瘤科在全国率先开展了扶正培本治则的临床和实验研究，80年代重点筛选以清热解毒药为主的抗肿瘤药物，90年代的工作重点则放在防止肿瘤术后转移复发的研究方面，先后承担了包括“六五”到“十一五”国家攻关课题在内的10余项国家级课题，近二十项省部级课题，近十项科学院院级课题，在肺癌和消化道等常见恶性肿瘤的治疗方面取得了突出的研究成果。曾获布鲁塞尔金奖，国家科委、卫生部、国家中医药管理局和中国中医研究院奖励多项。余桂清主任还获得了世界阿尔伯特·爱因斯坦医学贡献奖。我科研制的健脾益肾颗粒、益肺清化膏获国家新药证书并获国家正式生产批准文号。
    我医疗中心下设医学情报室、中医理论研究室、流式细胞仪室、肿瘤药理研究室、肿瘤免疫研究室、细胞生物学研究室等，为肿瘤临床医疗和基础实验提供服务。实验室对外开放，承担着大量国家及部局级科研课题。实验室的专家顾问委员会和技术指导委员会成员均为全国著名的专家，不少国内的硕士、博士和国外的研究生、进修生来实验室开展课题研究。此外，我实验室还进行了广泛的国际协作，与韩国SK集团成立广安门医院-SK集团中韩联合研究室，在抑制肿瘤血管生成方面进行了合作研究。随着中医肿瘤医学在国际上的影响和地位日益提高，我科与美国NCCI在肿瘤替代医学领域建立了合作关系，并在人才培养和课题协作方面有了实质进展。与WHO传统医学亚太地区中心合作开展肿瘤中医规范化治疗指南的制订工作。我科与马来西亚同善医院进行了至今为期十五年的临床合作，每年诊治癌症患者一万余人次，其影响辐射新加坡、印度尼西亚、菲律宾等东南亚国家和地区，在当地华人中获得了良好的声誉。
    另外，肿瘤科还是卫生部新药审评中医肿瘤临床药理研究基地，中国中西医结合学会肿瘤专业委员会、中国抗癌协会肿瘤传统医学委员会及中国癌症基金会中医肿瘤专业委员会的牵头单位，多次主持召开国际和全国性学术会议，为国内培训了大量中医及中西医结合肿瘤专业人才。为了更好地宣传中医、中西医结合肿瘤临床及实验研究的成果，我科正在筹备出版中华中医肿瘤杂志。
    做为国家教委批准的硕士研究生、博士研究生的带教单位和博士后流动工作站，近20年来，我科已培养硕士、博士、博士后数十人。为了提高我国现有中西医结合治疗肿瘤的高级医师和学术带头人的学术水平，并对基层从事肿瘤防治的医护人员进行培训，我科还设立了全国教育培训部，做为唯一入选的中医科室协助国家进行了西部贫困地区天使工程的中医肿瘤培训项目。培训中心除了接受来自国内的数百名进修生学习以外，也接受了来自新加坡、韩国、朝鲜、马来西亚、加拿大、美国、意大利、以色列等许多热衷于中医肿瘤工作的国外医生和学者，为他们提供教学服务和医疗实践基地。我科也先后多次派人赴欧美、亚洲及港澳台等国家和地区进行学术交流，并为外国元首和国际友人提供医疗服务，受到广泛赞誉。为弘扬祖国医学在世界的影响做出了积极的贡献，扩大了祖国医学在防治肿瘤领域的国际影响。经过肿瘤科几代医务工作者四十余年的辛勤努力，我科在中医、中西医结合治疗肿瘤领域享有盛誉。